Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL13O43927 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL13O43927 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL13O43927 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL13O43927 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL13O43927 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL13O43927 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL13O43927 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL13O43927 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL13O43927 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms