Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CITO14578 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CITO14578 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CITO14578 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CITO14578 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CITO14578 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CITO14578 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CITO14578 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CITO14578 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CITO14578 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CITO14578 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CITO14578 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CITO14578 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CITO14578 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CITO14578 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CITO14578 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CITO14578 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CITO14578 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CITO14578 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CITO14578 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CITO14578 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CITO14578 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CITO14578 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CITO14578 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CITO14578 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CITO14578 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CITO14578 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CITO14578 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CITO14578 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CITO14578 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CITO14578 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CITO14578 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CITO14578 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CITO14578 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CITO14578 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CITO14578 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CITO14578 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CITO14578 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CITO14578 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CITO14578 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CITO14578 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CITO14578 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CITO14578 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CITO14578 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CITO14578 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CITO14578 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CITO14578 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CITO14578 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CITO14578 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CITO14578 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CITO14578 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CITO14578 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CITO14578 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CITO14578 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CITO14578 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CITO14578 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CITO14578 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CITO14578 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CITO14578 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CITO14578 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CITO14578 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CITO14578 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CITO14578 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CITO14578 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CITO14578 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CITO14578 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CITO14578 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CITO14578 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CITO14578 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CITO14578 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CITO14578 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CITO14578 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CITO14578 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CITO14578 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms