Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01387J3KSC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC01387J3KSC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01387J3KSC0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01387J3KSC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 454.8 ms