Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3P2A8K0S8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3P2A8K0S8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.58■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS3P2A8K0S8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS3P2A8K0S8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS3P2A8K0S8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms