Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN11A1L157 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN11A1L157 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN11A1L157 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN11A1L157 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms