Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms