Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA6Q9UF33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHA6Q9UF33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA6Q9UF33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA6Q9UF33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA6Q9UF33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms