Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GULP1Q9UBP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GULP1Q9UBP9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GULP1Q9UBP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GULP1Q9UBP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GULP1Q9UBP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GULP1Q9UBP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GULP1Q9UBP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GULP1Q9UBP9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GULP1Q9UBP9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GULP1Q9UBP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms