Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D2Q9NY47 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D2Q9NY47 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D2Q9NY47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D2Q9NY47 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms