Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DCAF4Q8WV16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DCAF4Q8WV16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DCAF4Q8WV16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DCAF4Q8WV16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DCAF4Q8WV16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms