Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2AF1L4Q8WU68 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2AF1L4Q8WU68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
U2AF1L4Q8WU68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
U2AF1L4Q8WU68 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2AF1L4Q8WU68 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms