Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BEST2Q8NFU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEST2Q8NFU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEST2Q8NFU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEST2Q8NFU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BEST2Q8NFU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEST2Q8NFU1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms