Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPA2Q8IWL1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA2Q8IWL1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFTPA2Q8IWL1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms