Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KCTD1Q719H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCTD1Q719H9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCTD1Q719H9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCTD1Q719H9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCTD1Q719H9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCTD1Q719H9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCTD1Q719H9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
KCTD1Q719H9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCTD1Q719H9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KCTD1Q719H9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCTD1Q719H9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms