Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEF1DP3Q658K8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EEF1DP3Q658K8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEF1DP3Q658K8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EEF1DP3Q658K8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EEF1DP3Q658K8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEF1DP3Q658K8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EEF1DP3Q658K8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms