Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
EEF1DP3Q658K8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
EEF1DP3Q658K8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
EEF1DP3Q658K8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EEF1DP3Q658K8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
EEF1DP3Q658K8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
EEF1DP3Q658K8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
EEF1DP3Q658K8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
EEF1DP3Q658K8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
EEF1DP3Q658K8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEF1DP3Q658K8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEF1DP3Q658K8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEF1DP3Q658K8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEF1DP3Q658K8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEF1DP3Q658K8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EEF1DP3Q658K8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
EEF1DP3Q658K8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
EEF1DP3Q658K8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EEF1DP3Q658K8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EEF1DP3Q658K8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EEF1DP3Q658K8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EEF1DP3Q658K8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EEF1DP3Q658K8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
EEF1DP3Q658K8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EEF1DP3Q658K8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
EEF1DP3Q658K8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EEF1DP3Q658K8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
EEF1DP3Q658K8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEF1DP3Q658K8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EEF1DP3Q658K8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEF1DP3Q658K8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEF1DP3Q658K8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EEF1DP3Q658K8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EEF1DP3Q658K8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EEF1DP3Q658K8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EEF1DP3Q658K8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EEF1DP3Q658K8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EEF1DP3Q658K8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EEF1DP3Q658K8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EEF1DP3Q658K8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEF1DP3Q658K8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEF1DP3Q658K8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
EEF1DP3Q658K8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EEF1DP3Q658K8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
EEF1DP3Q658K8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EEF1DP3Q658K8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EEF1DP3Q658K8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EEF1DP3Q658K8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EEF1DP3Q658K8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EEF1DP3Q658K8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EEF1DP3Q658K8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EEF1DP3Q658K8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EEF1DP3Q658K8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
EEF1DP3Q658K8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EEF1DP3Q658K8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
EEF1DP3Q658K8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
EEF1DP3Q658K8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
EEF1DP3Q658K8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EEF1DP3Q658K8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
EEF1DP3Q658K8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EEF1DP3Q658K8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EEF1DP3Q658K8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EEF1DP3Q658K8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EEF1DP3Q658K8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EEF1DP3Q658K8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EEF1DP3Q658K8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EEF1DP3Q658K8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EEF1DP3Q658K8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EEF1DP3Q658K8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEF1DP3Q658K8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEF1DP3Q658K8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EEF1DP3Q658K8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EEF1DP3Q658K8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEF1DP3Q658K8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EEF1DP3Q658K8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EEF1DP3Q658K8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EEF1DP3Q658K8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EEF1DP3Q658K8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EEF1DP3Q658K8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EEF1DP3Q658K8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EEF1DP3Q658K8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EEF1DP3Q658K8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EEF1DP3Q658K8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EEF1DP3Q658K8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
EEF1DP3Q658K8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EEF1DP3Q658K8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEF1DP3Q658K8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEF1DP3Q658K8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EEF1DP3Q658K8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EEF1DP3Q658K8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EEF1DP3Q658K8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EEF1DP3Q658K8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EEF1DP3Q658K8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
EEF1DP3Q658K8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms