Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NBPF1Q3BBV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NBPF1Q3BBV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NBPF1Q3BBV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
NBPF1Q3BBV0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NBPF1Q3BBV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms