Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH18Q13634 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH18Q13634 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH18Q13634 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH18Q13634 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH18Q13634 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
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