Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB3BPQ13352 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB3BPQ13352 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB3BPQ13352 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB3BPQ13352 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB3BPQ13352 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB3BPQ13352 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms