Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMAN2Q12907 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMAN2Q12907 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMAN2Q12907 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMAN2Q12907 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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