Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CGNL1Q0VF96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CGNL1Q0VF96 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CGNL1Q0VF96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CGNL1Q0VF96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CGNL1Q0VF96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CGNL1Q0VF96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CGNL1Q0VF96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms