Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA1P56159 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFRA1P56159 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA1P56159 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA1P56159 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA1P56159 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms