Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GFRA1P56159 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GFRA1P56159 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GFRA1P56159 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GFRA1P56159 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GFRA1P56159 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GFRA1P56159 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GFRA1P56159 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GFRA1P56159 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GFRA1P56159 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GFRA1P56159 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GFRA1P56159 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GFRA1P56159 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GFRA1P56159 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GFRA1P56159 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GFRA1P56159 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GFRA1P56159 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GFRA1P56159 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GFRA1P56159 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GFRA1P56159 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GFRA1P56159 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GFRA1P56159 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GFRA1P56159 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFRA1P56159 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GFRA1P56159 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GFRA1P56159 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GFRA1P56159 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GFRA1P56159 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GFRA1P56159 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GFRA1P56159 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GFRA1P56159 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GFRA1P56159 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GFRA1P56159 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GFRA1P56159 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GFRA1P56159 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GFRA1P56159 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GFRA1P56159 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GFRA1P56159 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GFRA1P56159 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA1P56159 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA1P56159 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRA1P56159 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRA1P56159 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA1P56159 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GFRA1P56159 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GFRA1P56159 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GFRA1P56159 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA1P56159 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GFRA1P56159 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GFRA1P56159 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GFRA1P56159 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GFRA1P56159 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GFRA1P56159 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GFRA1P56159 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GFRA1P56159 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA1P56159 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA1P56159 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GFRA1P56159 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GFRA1P56159 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GFRA1P56159 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA1P56159 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GFRA1P56159 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GFRA1P56159 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GFRA1P56159 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GFRA1P56159 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GFRA1P56159 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GFRA1P56159 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GFRA1P56159 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRA1P56159 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA1P56159 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GFRA1P56159 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRA1P56159 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA1P56159 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFRA1P56159 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GFRA1P56159 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA1P56159 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA1P56159 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRA1P56159 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFRA1P56159 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFRA1P56159 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA1P56159 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA1P56159 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA1P56159 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA1P56159 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA1P56159 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA1P56159 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA1P56159 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA1P56159 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFRA1P56159 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFRA1P56159 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA1P56159 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFRA1P56159 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFRA1P56159 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFRA1P56159 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms