Protein–RNA interactions for Protein: P50851

LRBA, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRBAP50851 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRBAP50851 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRBAP50851 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRBAP50851 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRBAP50851 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRBAP50851 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRBAP50851 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRBAP50851 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRBAP50851 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRBAP50851 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRBAP50851 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRBAP50851 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRBAP50851 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRBAP50851 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRBAP50851 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRBAP50851 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRBAP50851 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRBAP50851 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRBAP50851 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRBAP50851 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRBAP50851 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRBAP50851 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRBAP50851 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRBAP50851 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRBAP50851 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRBAP50851 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRBAP50851 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRBAP50851 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRBAP50851 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRBAP50851 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRBAP50851 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRBAP50851 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRBAP50851 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRBAP50851 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRBAP50851 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRBAP50851 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRBAP50851 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRBAP50851 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRBAP50851 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRBAP50851 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRBAP50851 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRBAP50851 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRBAP50851 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRBAP50851 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRBAP50851 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRBAP50851 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRBAP50851 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRBAP50851 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRBAP50851 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRBAP50851 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRBAP50851 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRBAP50851 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRBAP50851 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRBAP50851 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRBAP50851 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRBAP50851 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRBAP50851 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRBAP50851 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRBAP50851 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRBAP50851 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRBAP50851 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRBAP50851 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRBAP50851 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRBAP50851 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRBAP50851 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRBAP50851 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRBAP50851 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRBAP50851 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRBAP50851 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRBAP50851 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRBAP50851 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRBAP50851 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRBAP50851 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRBAP50851 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRBAP50851 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRBAP50851 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRBAP50851 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRBAP50851 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRBAP50851 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRBAP50851 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRBAP50851 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRBAP50851 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms