Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA4P48169 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA4P48169 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRA4P48169 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA4P48169 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms