Protein–RNA interactions for Protein: P27539

GDF1, Embryonic growth/differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF1P27539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF1P27539 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF1P27539 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF1P27539 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF1P27539 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF1P27539 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF1P27539 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF1P27539 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF1P27539 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF1P27539 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF1P27539 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF1P27539 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF1P27539 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF1P27539 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF1P27539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF1P27539 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF1P27539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF1P27539 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF1P27539 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF1P27539 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF1P27539 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF1P27539 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF1P27539 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF1P27539 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF1P27539 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF1P27539 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF1P27539 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF1P27539 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF1P27539 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF1P27539 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF1P27539 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF1P27539 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF1P27539 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF1P27539 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF1P27539 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF1P27539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF1P27539 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF1P27539 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF1P27539 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF1P27539 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF1P27539 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF1P27539 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF1P27539 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF1P27539 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF1P27539 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF1P27539 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF1P27539 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF1P27539 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF1P27539 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF1P27539 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF1P27539 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF1P27539 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF1P27539 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF1P27539 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF1P27539 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF1P27539 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF1P27539 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF1P27539 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF1P27539 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF1P27539 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF1P27539 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF1P27539 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF1P27539 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF1P27539 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF1P27539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF1P27539 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF1P27539 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF1P27539 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF1P27539 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF1P27539 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF1P27539 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF1P27539 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms