Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYH1P12882 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYH1P12882 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYH1P12882 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYH1P12882 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYH1P12882 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYH1P12882 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYH1P12882 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYH1P12882 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
MYH1P12882 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
MYH1P12882 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MYH1P12882 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYH1P12882 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYH1P12882 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYH1P12882 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
MYH1P12882 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYH1P12882 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYH1P12882 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYH1P12882 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MYH1P12882 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYH1P12882 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYH1P12882 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYH1P12882 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYH1P12882 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYH1P12882 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYH1P12882 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYH1P12882 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYH1P12882 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYH1P12882 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYH1P12882 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYH1P12882 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYH1P12882 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYH1P12882 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYH1P12882 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYH1P12882 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MYH1P12882 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MYH1P12882 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MYH1P12882 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MYH1P12882 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MYH1P12882 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYH1P12882 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYH1P12882 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYH1P12882 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYH1P12882 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYH1P12882 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYH1P12882 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYH1P12882 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MYH1P12882 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYH1P12882 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH1P12882 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH1P12882 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH1P12882 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH1P12882 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MYH1P12882 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MYH1P12882 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MYH1P12882 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MYH1P12882 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MYH1P12882 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MYH1P12882 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MYH1P12882 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MYH1P12882 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MYH1P12882 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MYH1P12882 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MYH1P12882 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MYH1P12882 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MYH1P12882 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MYH1P12882 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH1P12882 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH1P12882 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH1P12882 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH1P12882 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH1P12882 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH1P12882 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH1P12882 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH1P12882 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH1P12882 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MYH1P12882 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MYH1P12882 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MYH1P12882 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MYH1P12882 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MYH1P12882 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms