Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HOXB7P09629 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HOXB7P09629 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HOXB7P09629 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HOXB7P09629 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HOXB7P09629 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
HOXB7P09629 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HOXB7P09629 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXB7P09629 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HOXB7P09629 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXB7P09629 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms