Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ATP10AO60312 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ATP10AO60312 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
ATP10AO60312 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ATP10AO60312 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ATP10AO60312 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
ATP10AO60312 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ATP10AO60312 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms