Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CITO14578 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CITO14578 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CITO14578 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CITO14578 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CITO14578 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CITO14578 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CITO14578 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CITO14578 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CITO14578 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CITO14578 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CITO14578 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CITO14578 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CITO14578 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CITO14578 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CITO14578 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CITO14578 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CITO14578 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CITO14578 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CITO14578 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CITO14578 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CITO14578 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CITO14578 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CITO14578 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CITO14578 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CITO14578 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CITO14578 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CITO14578 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CITO14578 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CITO14578 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CITO14578 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CITO14578 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CITO14578 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CITO14578 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CITO14578 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CITO14578 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CITO14578 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CITO14578 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CITO14578 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CITO14578 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CITO14578 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CITO14578 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CITO14578 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CITO14578 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CITO14578 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CITO14578 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CITO14578 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CITO14578 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CITO14578 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CITO14578 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CITO14578 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CITO14578 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CITO14578 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CITO14578 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CITO14578 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CITO14578 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CITO14578 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CITO14578 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CITO14578 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CITO14578 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CITO14578 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CITO14578 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CITO14578 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CITO14578 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CITO14578 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CITO14578 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CITO14578 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CITO14578 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CITO14578 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CITO14578 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CITO14578 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CITO14578 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CITO14578 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CITO14578 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CITO14578 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CITO14578 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CITO14578 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CITO14578 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CITO14578 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CITO14578 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CITO14578 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CITO14578 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CITO14578 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CITO14578 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CITO14578 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CITO14578 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CITO14578 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CITO14578 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CITO14578 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CITO14578 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CITO14578 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CITO14578 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CITO14578 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CITO14578 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms