Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FITM1A5D6W6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FITM1A5D6W6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FITM1A5D6W6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FITM1A5D6W6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FITM1A5D6W6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FITM1A5D6W6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FITM1A5D6W6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FITM1A5D6W6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms