Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
LAMC3Q9Y6N6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC46.18■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
LAMC3Q9Y6N6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
LAMC3Q9Y6N6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC46.03■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
LAMC3Q9Y6N6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
LAMC3Q9Y6N6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
LAMC3Q9Y6N6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
LAMC3Q9Y6N6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
LAMC3Q9Y6N6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
LAMC3Q9Y6N6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
LAMC3Q9Y6N6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
LAMC3Q9Y6N6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
LAMC3Q9Y6N6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.92
LAMC3Q9Y6N6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.72■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
LAMC3Q9Y6N6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
LAMC3Q9Y6N6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
LAMC3Q9Y6N6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms