Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMACHCQ9Y4U1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMACHCQ9Y4U1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMACHCQ9Y4U1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMACHCQ9Y4U1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms