Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MMACHCQ9Y4U1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MMACHCQ9Y4U1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MMACHCQ9Y4U1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
MMACHCQ9Y4U1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MMACHCQ9Y4U1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MMACHCQ9Y4U1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MMACHCQ9Y4U1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MMACHCQ9Y4U1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMACHCQ9Y4U1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMACHCQ9Y4U1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMACHCQ9Y4U1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMACHCQ9Y4U1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MMACHCQ9Y4U1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MMACHCQ9Y4U1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MMACHCQ9Y4U1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMACHCQ9Y4U1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MMACHCQ9Y4U1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MMACHCQ9Y4U1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMACHCQ9Y4U1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMACHCQ9Y4U1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMACHCQ9Y4U1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMACHCQ9Y4U1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MMACHCQ9Y4U1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMACHCQ9Y4U1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMACHCQ9Y4U1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMACHCQ9Y4U1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMACHCQ9Y4U1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMACHCQ9Y4U1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMACHCQ9Y4U1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMACHCQ9Y4U1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMACHCQ9Y4U1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMACHCQ9Y4U1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMACHCQ9Y4U1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMACHCQ9Y4U1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMACHCQ9Y4U1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMACHCQ9Y4U1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMACHCQ9Y4U1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMACHCQ9Y4U1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMACHCQ9Y4U1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMACHCQ9Y4U1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMACHCQ9Y4U1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMACHCQ9Y4U1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMACHCQ9Y4U1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMACHCQ9Y4U1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMACHCQ9Y4U1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MMACHCQ9Y4U1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MMACHCQ9Y4U1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMACHCQ9Y4U1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMACHCQ9Y4U1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMACHCQ9Y4U1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMACHCQ9Y4U1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMACHCQ9Y4U1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMACHCQ9Y4U1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMACHCQ9Y4U1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMACHCQ9Y4U1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMACHCQ9Y4U1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMACHCQ9Y4U1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MMACHCQ9Y4U1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMACHCQ9Y4U1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMACHCQ9Y4U1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMACHCQ9Y4U1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMACHCQ9Y4U1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MMACHCQ9Y4U1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMACHCQ9Y4U1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMACHCQ9Y4U1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMACHCQ9Y4U1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMACHCQ9Y4U1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMACHCQ9Y4U1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMACHCQ9Y4U1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMACHCQ9Y4U1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MMACHCQ9Y4U1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMACHCQ9Y4U1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMACHCQ9Y4U1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMACHCQ9Y4U1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMACHCQ9Y4U1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMACHCQ9Y4U1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMACHCQ9Y4U1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMACHCQ9Y4U1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMACHCQ9Y4U1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMACHCQ9Y4U1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMACHCQ9Y4U1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMACHCQ9Y4U1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMACHCQ9Y4U1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMACHCQ9Y4U1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMACHCQ9Y4U1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMACHCQ9Y4U1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMACHCQ9Y4U1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMACHCQ9Y4U1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMACHCQ9Y4U1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMACHCQ9Y4U1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMACHCQ9Y4U1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMACHCQ9Y4U1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMACHCQ9Y4U1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMACHCQ9Y4U1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMACHCQ9Y4U1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MMACHCQ9Y4U1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMACHCQ9Y4U1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 764 ms