Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA1Q9UND3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA1Q9UND3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPIPA1Q9UND3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPIPA1Q9UND3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms