Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms