Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRODH2Q9UF12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRODH2Q9UF12 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRODH2Q9UF12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRODH2Q9UF12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRODH2Q9UF12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRODH2Q9UF12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms