Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARGC1AQ9UBK2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARGC1AQ9UBK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARGC1AQ9UBK2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms