Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00474Q9P2X8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00474Q9P2X8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00474Q9P2X8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00474Q9P2X8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00474Q9P2X8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00474Q9P2X8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00474Q9P2X8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00474Q9P2X8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms