Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBCCD1Q9NVR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBCCD1Q9NVR7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBCCD1Q9NVR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBCCD1Q9NVR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms