Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9N2J8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9N2J8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9N2J8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9N2J8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9N2J8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9N2J8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9N2J8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9N2J8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9N2J8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9N2J8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9N2J8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9N2J8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9N2J8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9N2J8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9N2J8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9N2J8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9N2J8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9N2J8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9N2J8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9N2J8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9N2J8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9N2J8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9N2J8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9N2J8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9N2J8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9N2J8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9N2J8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9N2J8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9N2J8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9N2J8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9N2J8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9N2J8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9N2J8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9N2J8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9N2J8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9N2J8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9N2J8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9N2J8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9N2J8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9N2J8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9N2J8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9N2J8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9N2J8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9N2J8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9N2J8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9N2J8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9N2J8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9N2J8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9N2J8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9N2J8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9N2J8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9N2J8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9N2J8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9N2J8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9N2J8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9N2J8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9N2J8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9N2J8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9N2J8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9N2J8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9N2J8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9N2J8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9N2J8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9N2J8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9N2J8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9N2J8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9N2J8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9N2J8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9N2J8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9N2J8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9N2J8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9N2J8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9N2J8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9N2J8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9N2J8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9N2J8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9N2J8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9N2J8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9N2J8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9N2J8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9N2J8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9N2J8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9N2J8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9N2J8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9N2J8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9N2J8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9N2J8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms