Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
HIRIP3Q9BW71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HIRIP3Q9BW71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
HIRIP3Q9BW71 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HIRIP3Q9BW71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HIRIP3Q9BW71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms