Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PI4K2AQ9BTU6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PI4K2AQ9BTU6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PI4K2AQ9BTU6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4K2AQ9BTU6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4K2AQ9BTU6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1435.2 ms