Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AKAP9Q99996 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AKAP9Q99996 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AKAP9Q99996 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AKAP9Q99996 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AKAP9Q99996 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms