Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP5Q96RT8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP5Q96RT8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP5Q96RT8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBGCP5Q96RT8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP5Q96RT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.8 ms