Protein–RNA interactions for Protein: Q96H35

RBM18, Probable RNA-binding protein 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM18Q96H35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM18Q96H35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM18Q96H35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM18Q96H35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM18Q96H35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM18Q96H35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms