Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HGDQ93099 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HGDQ93099 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HGDQ93099 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HGDQ93099 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HGDQ93099 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HGDQ93099 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HGDQ93099 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HGDQ93099 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HGDQ93099 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HGDQ93099 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HGDQ93099 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HGDQ93099 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HGDQ93099 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HGDQ93099 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HGDQ93099 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HGDQ93099 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HGDQ93099 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HGDQ93099 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HGDQ93099 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HGDQ93099 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HGDQ93099 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HGDQ93099 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HGDQ93099 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HGDQ93099 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HGDQ93099 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HGDQ93099 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HGDQ93099 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HGDQ93099 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HGDQ93099 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HGDQ93099 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HGDQ93099 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HGDQ93099 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HGDQ93099 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HGDQ93099 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HGDQ93099 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HGDQ93099 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HGDQ93099 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HGDQ93099 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HGDQ93099 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HGDQ93099 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HGDQ93099 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HGDQ93099 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HGDQ93099 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HGDQ93099 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HGDQ93099 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HGDQ93099 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HGDQ93099 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HGDQ93099 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HGDQ93099 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HGDQ93099 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HGDQ93099 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HGDQ93099 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HGDQ93099 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HGDQ93099 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HGDQ93099 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HGDQ93099 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HGDQ93099 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HGDQ93099 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HGDQ93099 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HGDQ93099 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HGDQ93099 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HGDQ93099 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HGDQ93099 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HGDQ93099 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HGDQ93099 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HGDQ93099 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HGDQ93099 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HGDQ93099 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HGDQ93099 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HGDQ93099 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HGDQ93099 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HGDQ93099 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HGDQ93099 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HGDQ93099 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HGDQ93099 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HGDQ93099 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HGDQ93099 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HGDQ93099 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HGDQ93099 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HGDQ93099 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HGDQ93099 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HGDQ93099 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HGDQ93099 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HGDQ93099 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HGDQ93099 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms