Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK9Q8TD19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK9Q8TD19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK9Q8TD19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEK9Q8TD19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEK9Q8TD19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms