Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER3Q8N944 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER3Q8N944 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AMER3Q8N944 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMER3Q8N944 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms