Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWA5B2Q8N398 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA5B2Q8N398 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VWA5B2Q8N398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA5B2Q8N398 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA5B2Q8N398 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA5B2Q8N398 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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